化肥大量使用使蔬菜瓜果品質大大下降。由于作物不僅僅需要氮磷鉀，同時還需要鈣鐵鋅硒等許多微量元素，而化肥一般成分比較單一，所以長期使用化肥必然導致土壤中所含養(yǎng)分趨于單一，易使作物營養(yǎng)失調，從而導致作物內部轉化合成受阻，必然導致作物品質下降，瓜不甜，菜不香。

化肥的大量使用，還造成土壤的有益菌、蚯蚓的大量死亡。

化肥長期低效施用，往往造成土壤中某些元素的過分積累和土壤理化性質的變化及環(huán)境的污染。

影響作物品質。由于農田大量施用單元素化肥，其養(yǎng)分不能被作物有效地吸收利用。氮、磷、鉀等一些化學物質易被土壤固結,使各種鹽分在土壤中積累，造成土壤養(yǎng)分失調，部分地塊的有害重金屬含量和有害病菌量超標，導致土壤性狀惡化，作物體內部分物質轉化合成受阻,使農產品品質。超量使用化肥使果蔬生長性狀低劣，并且容易腐爛，不宜存放。